微生物實驗室的建設(shè)在有些領(lǐng)域下是必要的，比如應(yīng)用于微生物學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、生物化學(xué)、動物實驗、基因工程以及生物制品等研究使用的實驗室統(tǒng)稱為生物安全實驗室。他不同于一般的實驗室或者是凈化工程，微生物實驗室是在一定的條件下保證工作人員的環(huán)境安全。
微生物實驗室由準(zhǔn)備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養(yǎng)室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是地板和墻壁的質(zhì)地光滑堅硬，儀器和設(shè)備的陳設(shè)簡潔，便于打掃衛(wèi)生。
無菌室的設(shè)置 無菌室應(yīng)根據(jù)既經(jīng)濟又科學(xué)的原則來設(shè)置。
其基本要求有以下幾點：
(1)無菌室應(yīng)有內(nèi)、外兩間，內(nèi)間是無菌室，外間是緩沖室。房間容積不宜過大，以便于空氣滅菌。小內(nèi)間面積2×2.5=5m2，外間面積1×2=2m2，高以2.5m以下為宜，都應(yīng)有天花板。
(2)內(nèi)間應(yīng)當(dāng)設(shè)拉門，以減少空氣的波動，門應(yīng)設(shè)在離工作臺遠(yuǎn)的位置上;外間的門好也用拉門，要設(shè)在距內(nèi)間遠(yuǎn)的位置上。
(3)在分隔內(nèi)間與外間的墻壁或“隔扇”上，應(yīng)開一個小窗，作接種過程中必要的內(nèi)外傳遞物品的通道，以減少人員進出內(nèi)間的次數(shù)，降低污染程度。小窗寬60cm、高40cm、厚30cm，內(nèi)外都掛對拉的窗扇。
(4)無菌室容積小而嚴(yán)密，使用一段時間后，室內(nèi)溫度很高，故應(yīng)設(shè)置通氣窗。通氣窗應(yīng)設(shè)在內(nèi)室進門處的頂棚上(即離工作臺遠(yuǎn)的位置)，好為雙層結(jié)構(gòu)，外層為百葉窗，內(nèi)層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內(nèi)室使用后、滅菌前開啟，以流通空氣，有條件可安裝恒溫。
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