高新技術企業(yè)認定是一個長期、系統(tǒng)的過程。說它是長期工程，因為認定的相關財務數據溯及以往不少于三年（成立不足三年的除外），即使認證通過，每三年還要進行復審，企業(yè)要做好打持久戰(zhàn)的準備。說它是系統(tǒng)工程，因為高新技術認證會涉及到研發(fā)、品管、生產、設備動力、銷售、采購、人力、財務等幾乎所有部門，高新技術認證就是將這些部門有機結合在一起，以研發(fā)為主線，有目的、有步驟、有計劃、有組織的開展系統(tǒng)工作。
為順利通過高新技術企業(yè)驗收，企業(yè)要重點做好以下工作：
一、研發(fā)組織機構要做到“四獨立”：
1、部門獨立：企業(yè)的發(fā)展要靠技術或產品的更新?lián)Q代和持續(xù)改進，才能不被市場所淘汰，研發(fā)部門在企業(yè)的組織結構中的地位不言而喻，所以在企業(yè)的層級管理或在組織機構圖中，研發(fā)部門要單獨列示，與其他部門平行，不能作為生產或品管的下級部門。如果企業(yè)有小試或中試車間，這些車間應作為研發(fā)部門的下級部門來管理。
2、人員獨立：研發(fā)人員也要獨立，每位研發(fā)人員要有具體的研發(fā)工作，最好不要兼任車間檢驗員、工藝員等類似崗位，避免相應的職工薪酬分攤問題。
3、研發(fā)場所獨立；研發(fā)場所一定要獨立，最好單獨辦公，并在顯眼位置標注“企業(yè)研發(fā)中心”等字樣。如果研發(fā)場所因條件所限位于生產車間或企業(yè)辦公樓內，一定要有明顯的門牌或區(qū)域標示。
4、研發(fā)設備獨立：研發(fā)設備一般要位于研發(fā)場所內，最好在每臺研發(fā)設備上都有相應的標示牌，指明設備名稱、用途等，并與研發(fā)設備臺賬相吻合。如果因試驗或工藝原因需要放置在生產車間，更應該標識清楚為研發(fā)設備。
二、研發(fā)規(guī)劃要做到“六明確”
研發(fā)部門建立后，公司董事會或類似權力機構要制定一個公司中長期的產品研發(fā)規(guī)劃，該規(guī)劃是企業(yè)進行高新技術企業(yè)認證的綱領性文件，所有與高新技術企業(yè)認定有關的軟硬件設施、文字材料、人員組織、財務核算設置等均圍繞該規(guī)劃展開。研發(fā)規(guī)劃期一般不短于六年，如果企業(yè)欲以過去三年的數據申報材料，那么研發(fā)規(guī)劃期最少包含過去三個會計年度、當前會計年度和未來兩個會計年度。過去三個會計年度是為申報高新技術企業(yè)做準備，當前和未來二個會計年度是為復審高新技術企業(yè)做準備。研發(fā)規(guī)劃要明確六個方面的內容：
1、研發(fā)項目名稱明確：
研發(fā)規(guī)劃中的研發(fā)項目名稱要言簡意賅，一般為“A產品（技術）研究開發(fā)”、“B產品產業(yè)化中試開發(fā)”等。研發(fā)項目一旦確定，財務部門要根據研發(fā)規(guī)劃在會計科目“研發(fā)支出”下增設與研發(fā)項目名稱一致的二級（或三級）會計科目，如“研發(fā)支出—費用化支出——A產品（技術）研究開發(fā)”，有幾個項目要增加幾個二級明細科目。
2、研發(fā)目標要明確：
任何一款產品都不是一成不變的，產品生產研發(fā)過程本身就是一個持續(xù)改進的過程，而且研發(fā)是全方位的，小到產品外觀、色度、粒度、體積、重量、形狀，大到性能改變、工藝改進等，所以研發(fā)目標一定要明確研發(fā)目的或標準，并且目標要盡量量化和直觀，易于觀測、檢測或計量，一般而言，是否達到研發(fā)目標需要企業(yè)委托社會獨立的檢測機構出具檢測報告，當然，如果企業(yè)的實驗室是經過有關部門認定的合格實驗室，也可以自己出具檢測報告。
3、研發(fā)時限要明確：
研發(fā)規(guī)劃中要明確項目研發(fā)所需要的時間、進度、節(jié)點等，最好用進度圖區(qū)分研發(fā)項目分別標示，以明確何時開始和結束該項目。在研發(fā)規(guī)劃中對研發(fā)過程中的節(jié)點控制也非常重要，節(jié)點控制是指截至某一時間研發(fā)項目要達到何種進度或標準，節(jié)點控制有助于企業(yè)確定繼續(xù)研發(fā)或放棄該項目研發(fā)。
4、研發(fā)人員要明確：
研發(fā)規(guī)劃中要明確每一個研發(fā)項目由那些研發(fā)人員參與。如果項目較多而研發(fā)人員較少，存在一個研發(fā)人員負責多個研發(fā)項目的情況，那么要在研發(fā)規(guī)劃中合理安排這部分研發(fā)人員的工作時間，比如本月和下月、上半年和下半年等，盡量避免時間交叉，方便財務核算時對相關研發(fā)費用的分攤和分配。
5、研發(fā)所用設備要明確：
研發(fā)規(guī)劃中要明確每一個研發(fā)項目需要那些研發(fā)設備，該規(guī)劃是對研發(fā)設備的折舊費用歸屬問題做出了明確的界定。
6、研發(fā)費用預算要明確：
企業(yè)進行研發(fā)活動必然帶來研發(fā)費用的增加，研發(fā)規(guī)劃中要明確每個項目的研發(fā)費用預算額，以利于企業(yè)對研發(fā)費用的控制及資金安排，該研發(fā)費用預算應經公司董事會或類似權力機構的批準。研發(fā)費用至少包括以下范圍：
(1)、新產品設計費、新工藝規(guī)程制定費以及與研發(fā)活動直接相關的技術圖書資料費、資料翻譯費。
(2)、從事研發(fā)活動直接消耗的材料、燃料和動力費用。
(3)、在職直接從事研發(fā)活動人員的工資、薪金、獎金、津貼、補貼。
(4)、專門用于研發(fā)活動的儀器、設備的折舊費或租賃費。
(5)、專門用于研發(fā)活動的軟件、專利權、非專利技術等無形資產的攤銷費用。
(6)、專門用于中間試驗和產品試制的模具、工藝裝備開發(fā)及制造費。
(7)、勘探開發(fā)技術的現場試驗費。
(8)、研發(fā)成果的論證、評審、驗收費用。
三、財務核算上做到“五區(qū)分”
1、研發(fā)設備和非研發(fā)設備折舊要區(qū)分：
在財務核算上，非研發(fā)設備的折舊和研發(fā)設備折舊要明確區(qū)分，非研發(fā)設備的折舊一般計入制造費用或期間費用，而研發(fā)設備折舊要計入研發(fā)支出。
2、研發(fā)人員和非研發(fā)人員工資要區(qū)分：
研發(fā)人員和非研發(fā)人員的工資、獎金、加班等要在工資表上單張列示，不要和非研發(fā)人員統(tǒng)計在一張表上，并且在工資單上列示的研發(fā)人員姓名要和研發(fā)規(guī)劃中研發(fā)人員名單相一致，從企業(yè)繳納的養(yǎng)老保險等社會保險名單中也能一一找到所有研發(fā)人員的繳費記錄。
除工資、社保之外的其他應付職工薪酬，確實無法區(qū)分的，應采取合理的辦法在研發(fā)人員和非研發(fā)人員之間分攤。實際操作中，如果分攤有難度，最好將這部分支出作為非研發(fā)費用處理。
3、研發(fā)材料和非研發(fā)材料要區(qū)分：
區(qū)分研發(fā)材料和非研發(fā)材料是企業(yè)在正常營運和財務核算中要注意的重要問題。研發(fā)部門領用材料時，領料單上除一般領料單應具備的要素外，尤其要注意以下幾個方面：領料部門應為研發(fā)部門、領料人應為研發(fā)人員、領料用途應標明用于那個研發(fā)項目、所領用的原料名稱應該是研發(fā)預算中已經列示的直接耗用材料的名稱。
領料單裝訂時，研發(fā)部門和非研發(fā)部門的領料單要單獨裝訂，以便于將來相關部門的復核和查驗。
4、研發(fā)用動力費用和非研發(fā)動力用動力費用要區(qū)分：
高新技術企業(yè)一般為工業(yè)生產型，企業(yè)在生產和研發(fā)過程中不可避免要用到自來水、電力、天然氣、蒸汽等動力費用。為將研發(fā)和非研發(fā)所用的動力費用準確區(qū)分，建議在水、電、氣、暖等動力管道通往研發(fā)場所的合適部位加裝水表、電表等計量裝置。
月末動力部門報送動力分配表時，應根據相關的計量裝置將研發(fā)和非研發(fā)所用的動力耗用量統(tǒng)計清楚。
5、其他研發(fā)費用和非研發(fā)費用要區(qū)分：
一般情況下，研發(fā)費用除應付研發(fā)人員職工薪酬、研發(fā)設備折舊、從事研發(fā)活動消耗的材料、燃料和動力費用等直接費用外，還包括專門用于研發(fā)活動的設備運行維護、調整、檢驗、維修等費用、新藥研制的臨床試驗費、研發(fā)成果的鑒定費用、與研發(fā)活動直接相關的技術圖書資料費、資料翻譯費、研發(fā)成果的論證、評審、驗收費用等相關費用。
在財務核算上，財務人員應準確把握研發(fā)費用的列支范圍，既要將研發(fā)費用算準、算足，避免遺漏，也要防止將非研發(fā)費用充當研發(fā)費用。
四、稅務申報做到“兩注意”
因為高新技術企業(yè)直接涉及到稅收減免，所以高新技術企業(yè)申報資料時就需要企業(yè)主管稅務機關認可后方可上報。如果企業(yè)計劃在短期內能順利通過高新技術企業(yè)驗收，那么企業(yè)至少需要提前兩個會計年度做好稅收申報工作。
1、注意每年要進行研發(fā)費用加計扣除申報工作。相關稅法規(guī)定，當期發(fā)生的研發(fā)費用符合條件的可以在所得稅前按150%列支。高新技術企業(yè)申報的核心數據就是研發(fā)費用比例問題，每年進行研發(fā)費用加計扣除申報工作，就是提前讓稅務局認可研發(fā)費用總額。稅務機關在對當年研發(fā)費用的發(fā)生情況進行認定前，一般會到企業(yè)實地調查，對不符合條件的研發(fā)費用給予剔除調整，企業(yè)在這個過程中應該按主管稅務機關的要求完善軟硬件設施，規(guī)范研發(fā)費用的列支。
2、注意稅務申報系統(tǒng)中所得稅匯算清繳數據與企業(yè)年度審計報告的一致性。因各種原因，企業(yè)的匯算清繳數據與年度審計報告和賬面數據可能不一致，特別是涉及到主營業(yè)務收入、主營業(yè)務成本、管理費用、利潤總額等關鍵數據，將來報送材料時可能會被要求出具很多說明，甚至會被認為申報材料不真實，所以企業(yè)在日常的財務工作要對這些關鍵數據的一致性要特別留意，避免因小失大。
綜上所述，高新技術企業(yè)申報雖然是一項系統(tǒng)而復雜的工作，牽涉面很廣，但如果企業(yè)不斷加強研發(fā)部門的日常管理，未雨綢繆，做好高新技術企業(yè)申報前的準備，做好財務核算的基礎工作，依法依規(guī)進行申報納稅，那么高新技術企業(yè)申報就會水到渠成。
