信息安全管理體系文件編制完成以后，組織應按照文件的控制要求進行審 核與批準，并發(fā)布實施，至此，信息安全管理體系將進入運行階段。體系運行初期一般稱為試運行期或磨合期，在此期間體系運行的 目的是要在實踐中檢驗體系的充分性、適用性和有效性。在體系運行初期，組織應加強運作力度，通過實施其手冊、程序和各種作業(yè) 指導性文件等一系列體系文件，充分發(fā)揮體系本身的各項功能，及時發(fā)現(xiàn)體系策劃本身存在的問題，找出問題根源，采取糾正措施， 糾正各種不符合，并按照更改控制程序要求對體系予以更改，以達到進一步完善信息安全管理體系的目的。
有針對性 地宣貫信息安全管理體系文件。
體系文件的培訓工作是體系運行的首要任務，培訓工作的質(zhì)量直接影響體系運行的結(jié) 果。組織應根據(jù)培訓工作計劃的安排并按照培訓程序的要求對全體員工實施培訓。通過培訓使全體員工認識到新建立或完善的信息安 全管理體系是對過去信息安全管理體系的變革，是為了向國際先進的信息安全管理標準接軌，要適應這種變革和新管理體系的運行， 就必須認真學習、貫徹信息安全管理體系文件。
實踐是檢驗真理的唯一標準。
體系文件通過試運行 必然會出現(xiàn)一些問題，全體員工應將實踐中出現(xiàn)的問題和改進意見如實反饋給有關(guān)部門，以便采取糾正措施。
將體系 試運行中暴露出的問題，如體系設計不周、項目不全等進行協(xié)調(diào)、改進。
信息安全管理體系的運行涉及組織體系范圍 的各個部門，在運行過程中，各項活動往往不可避免的發(fā)生偏離標準的現(xiàn)象，因此，組織應按照嚴密、協(xié)調(diào)、高效、精簡、統(tǒng)一的原 則，建立信息反饋與信息安全協(xié)調(diào)機制對異常信息反饋和處理，對出現(xiàn)的問題加以改進，并保證體系的持續(xù)正常運行。
加強有關(guān)體系運行信息的管理，不僅是信息安全管理體系試運行本身的需要，也是保證試運行成功的關(guān)鍵。
所有與 信息安全管理體系活動有關(guān)的人員都應按體系文件要求，做好信息安全的信息收集、分析、傳遞、反饋、處理和歸檔等工作。
信息安全體系文件屬于組織的信息資產(chǎn)，包含有關(guān)組織的全部安全管理等敏感信息，組織應按照信息分類的原則對其 進行分類、進行密級標注并實行嚴格的安全控制，未經(jīng)授權(quán)不得隨意復制或借閱。
策劃階段，組織應：
定義ISMS的范圍和方針；
定義風險評估的系統(tǒng)性方法；
識別風險；
應用組織確定的系統(tǒng)性方法評估風險；
識別并評估可選的風險處理方式；
選擇控制目標與控制方式；
當決定接受剩余風險時應獲得管理者同意，并獲得管理者授權(quán)開始運行信息安全管理體系。
實施階段，組織應該實施選擇的控制，包括：
實施特定的管理程序；
實施所選擇的控制；
運作管理；
實施能夠促進安全事件檢測和響應的程序和其他控制。
檢查階段，組織應：
執(zhí)行程序，檢測錯誤和違背方針的行為 ；
定期評審ISMS的有效性；
評審剩余風險和可接受風險的等級；
執(zhí)行管理程序以確定規(guī)定的安全程序是否適當，是否符合標準，以及是否按照預期的目的進行工作；
定期對ISMS進行正式評審，以確保范圍保持充分性，以及ISMS過程的持續(xù)改進得到識別并實施；
記錄并報告所有活動和事件。
改進措施階段，組織應：
測量ISMS績效；
識別ISMS的改進措施，并有效實施；
采取適當?shù)募m正和預防措施；
與涉及到的所有相關(guān)方磋商、溝通結(jié)果及其措施；
必要時修改ISMS，確保修改達到既定的目標。
ISMS：ISMS（Information Security Management System）是信息安全管理體系。ISOIEC17799:2000它是繼ISO9000、ISO14000和OHSAS18000之后，又產(chǎn)生的一個管理體系標準—信息安全管理體系標準。
信息安全就是組織應明確需要保護的信息資源，確保信息的機密性、完整性和 可用性，并保持良好的協(xié)調(diào)狀態(tài)。信息安全對企業(yè)經(jīng)營非常重要，為了防止信息安全事故或事件的發(fā)生，盡管在技術(shù)方面采取了防火 墻和入侵監(jiān)測系統(tǒng)，但是人為因素造成的信息機密流失仍然占有很高的比率（據(jù)說約70%）。因此，建立信息安全管理體系十分必要。
為了建立、實施和保持信息安全管理體系，首先應策劃信息安全管理體系的方針和目標，識別、分類和清理信息資源，根據(jù)其危險程度、薄弱環(huán)節(jié)和發(fā)生頻次，實施風險控制，包括回避、轉(zhuǎn)移、控制和消除風險。按PDCA循環(huán)模式，建立信息安全管理體系。建立信息安全管理體系共有8個階段。包括確定ISMS適用范圍、策劃ISMS方針目標、策劃風險控制的過程、識別和評估風險、對風險控制現(xiàn)狀分析、選擇和制訂管理方案、識別存在的遺留風險和正式實施ISMS。
用于 ISMS認證的標準有ISOIEC17799:2000和BS7799-2:1999。據(jù)說，到2003年8月15日止，按BS7799認證的企業(yè)全共有282家，其中中國有5家。英國多，有99家。ISOIEC JTC1SC27正在對ISOIEC17799:2000進行修訂。預計2004或2005年正式發(fā)布修訂版本。采用ISOIEC17799建立ISMS，并取得認證的好處在于能夠建立完善的信息安全管理體系，從管理角度防止信息系統(tǒng)出現(xiàn)安全事故或事件；對外樹立信息系統(tǒng)可靠性形象，滿足顧客要求，提高企業(yè)競爭能力。認證的范圍適合于所有類型和規(guī)模的組織，特別是涉及個人信息保護的組織，例如金融、通訊、醫(yī)療、社區(qū)管理、電子商務和電子政務等。